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珠海深圳清華大學研究院創新中心（以下簡稱“創新中心”）是根據2014年清華大學與珠海市政府簽訂的戰略合作協議和珠海市政府與深圳清華大學研究院簽訂合作協議，由深圳清華大學研究院代表清華大學，與珠海市人民政府共同發起，在珠海設立的從事科研與開發、成果轉化、創業投資、人才培養等相關活動的新型研發機構。創新中心按企業化方式運作，由珠海市科技與工業信息化局作為業務主管部門，由珠海市國資委作為資產管理部門。

創新中心將依照珠海市的“三高一特”現代產業規劃以及高新區“4+2”產業規劃，結合珠海的產業基礎、產業政策和自身的資源，重點發展電子信息、醫療健康、新能源及高端制造等產業方向，在項目、資金、技術、人才等方面優先配置資源。目前，創新中心已建成珠海智能電網研究院和無人機工程技術中心等重大技術平臺，正在籌建的實驗室和研發平臺包括清華大學能源互聯網研究院珠海分院、生命健康研究院、清華大學生命科學院結構生物學珠海研發平臺、機器視覺工程技術中心等重大技術平臺。

創新中心與清華大學保持緊密聯系，結合高新區“4+2”重要組成部分的“軟件與集成電路產業”，重點與清華大學微電子研究所合作，結合“智能電網”產業與清華大學電機系合作，結合“醫療器械”方向重點與清華大學醫學院、清華大學生命科學院合作，結合“高端制造產業”與清華大學機械系、精密儀器系合作，另外在金灣區“航空產業”方向與清華大學航空航天學院合作，“新能源及新材料”方向與清華大學核能與新能源研究院合作。重點優先向珠海輸送項目及人才。深圳清華大學研究院的研究資源面向創新中心全面開放。